Les protéines
Les
protéines
À
quoi servent les protéines?
De nombreux gènes
codent pour des chaînes polypeptidiques particulières. Et les protéines
comprennent une ou
plusieurs chaînes polypeptidiques.
Ce sont les protéines
qui sont responsables des caractéristiques d'un organisme ou d'une
cellule. La façon
dont les protéines sont construites, selon une matrice génétique, est décrite
dans la section sur
la synthèse des protéines.
Les protéines ont
diverses vocations et donnent aux cellules vivantes leurs diverses formes et
fonctions. Certaines
protéines ont une fonction structurale; ces protéines fabriquent le
cartilage, les
cheveux et les ongles, par exemple. Une catégorie spéciale de protéines, les
enzymes, catalysent
d'importantes réactions chimiques dans la cellule qui ne pourraient
normalement se
produire en leur absence. Certaines protéines servent de canaux
membranaires
qui facilitent le passage des particules moléculaires vers ou hors
de la
cellule. Certaines
hormones, comme l'insuline, sont des protéines qui régulent les fonctions
du corps (l'insuline
contrôle le taux de sucre dans le sang). Les protéines sont également
requises pour la contraction
des muscles et aident les cellules du corps à se défendre
contre les
envahisseurs étrangers. Les fonctions susmentionnées ne constituent qu'une
partie
des diverses
fonctions des protéines.
Structure
de la protéine
Toutes les protéines
sont constituées d'une ou de plusieurs longues
molécules appelées polypeptides.
Chaque polypeptide
est composé de petites molécules reliées bout à bout
et appelées acides aminés. Les 20 types d'acides aminés
utilisés par les cellules vivantes ont tous une
structure d'armature identique, qui sert à lier ensemble les acides
aminés en une longue chaîne. Chaque type d'acide aminé
possède également ce qu'on appelle un groupe
latéral, distinct sur le plan chimique, selon le type d'acide
aminé. Bien qu'il ne soit pas nécessaire d'exposer
en détail la façon dont varient les structures des
groupes latéraux, mentionnons qu'ils peuvent être
regroupés en plusieurs catégories. Par exemple, certains
groupes latéraux sont non polaires,
tandis que d'autres sont polaires. Les molécules polaires et
non polaires restent généralement éloignées les unes
des autres. (Avez-vous jamais remarqué
que l'huile de cuisson et l'eau ne se mélangent pas,
mais demeurent ensemble dans de grosses bulles? C'est
justement parce que les molécules d'huile sont non polaires,
et les molécules d'eau, polaires) Les molécules d'eau sont polaires,
et comme les molécules non polaires n'aiment pas
s'associer à des molécules polaires, nous appelons souvent les
molécules non polaires hydrophobes
(du grec, « craignant l'eau »). Par ailleurs, les molécules
polaires sont hydrophiles (du grec, « aimant l'eau »),
car elles aiment interagir avec l'eau. Les
protéines, qui flottent dans la cellule ou n'importe
où dans votre corps, sont entourées d'un milieu
principalement aqueux.. Qu'arrive-t-il à la longue chaîne
d'acides aminés, dont certains sont hydrophobes et
d'autres hydrophiles? La
protéine se plie en une structure en trois dimensions où
la plupart des acides aminés hydrophobes sont
tournés vers l'intérieur de la structure (s'écartant de l'eau) et où la plupart des acides aminés
hydrophiles se trouvent en surface, tournés vers l'eau. En conséquence, lestypes d'acides
aminés et l'ordre dans lequel ils se situent dans la chaîne détermineront comment la protéine finira par se
plier dans l'eau, et, dès lors, sa structure en trois dimensions dans votre corps. Cette structure tridimensionnelle
est essentielle au bon fonctionnement de la protéine.
Une protéine de transport
membranaire,
par exemple, est intégrée dans la membrane de la cellule et a la
forme d'un tunnel ou d'un corridor reliant chaque côté
de la membrane à l'autre. Elle a pour tâche de
permettre à certaines molécules qui le peuvent d'entrer
ou de sortir de la cellule. De toute évidence, la
forme de la protéine de transport est très importante
pour qu'elle puisse remplir correctement sa fonction! Une
protéine de transport mal formée peut avoir un corridor «
bloqué », ce qui signifie que les grosses molécules ne
peuvent entrer ou sortir de la cellule. Les enzymes
constituent un autre exemple de catégorie de protéines dont la
forme est essentielle à leur on fonctionnement.
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